Muzeum jest samorządową instytucją kultury o
charakterze naukowo-badawczym i kulturalno-oświatowym.
Organizatorem Muzeum jest Województwo Kujawsko-Pomorskie.
Ogólny nadzór nad Muzeum sprawuje Minister Kultury, a nadzór bezpośredni
Zarząd Województwa Kujawsko-Pomorskiego.
Muzeum wpisane jest pod numerem EK II 4011/04/99 do Rejestru Instytucji
Kultury prowadzonego przez organizatora i posiada osobowość prawną.